El primer español en pisar tierras santafesinas fue Sebastián Gaboto, que en 1527 funda el fuerte Sancti Spiritu en la desembocadura del Río Carcarañá, pero la población no tarda en abandonarlo.
Años más tarde, los españoles decidieron fundar otras poblaciones sobre la costa del río para «abrir puertas a la tierra», esto significaba fundar puertos para poder comercializar los productos de la agricultura.

El 15 de noviembre de 1573 ,Juan de Garay, por encargo del gobernador de Asunción, deja oficialmente fundada la ciudad, en la barranca occidental del río de los Quiloazas, hoy Río San Javier, llamando a su ciudad Santa Fe de la Vera Cruz.